Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C18orf8Q96DM3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C18orf8Q96DM3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms