Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TM4SF18Q96CE8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TM4SF18Q96CE8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms