Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM3DQ96BQ1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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