Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 PTCHD4-202ENST00000398738 3232 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.848e-7■■■■■ 48.3
TBRG4Q969Z0 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.898e-7■■■■■ 48.3
TBRG4Q969Z0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.294e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SGSM2-207ENST00000573062 1335 ntTSL 227.51■■□□□ 1.994e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.94e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.624e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.274e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.244e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.24e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 KLHL26-203ENST00000595423 554 ntTSL 222.46■■□□□ 1.194e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.14e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RALB-204ENST00000431732 767 ntTSL 521.87■■□□□ 1.094e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 BICRA-202ENST00000594866 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.72■■□□□ 1.074e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.074e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 221.62■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.044e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 OGFOD3-208ENST00000580445 1274 ntTSL 1 (best)20.8■□□□□ 0.924e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 520.74■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.894e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 FYN-219ENST00000518295 1012 ntTSL 520.52■□□□□ 0.884e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 420.47■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 MFSD12-214ENST00000615073 986 ntTSL 320.43■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.834e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RGS12-205ENST00000502947 2237 ntTSL 1 (best)20.13■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.794e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.794e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.784e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.714e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 48.1
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TBRG4Q969Z0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CORO1B-204ENST00000537042 1954 ntTSL 518.23■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AP2A2-216ENST00000529438 572 ntTSL 418.03■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RUNX1-208ENST00000455571 610 ntTSL 317.97■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 AC073896.1-202ENST00000547423 566 ntTSL 417.34■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 WFIKKN1-202ENST00000573440 4878 nt17.3■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 48.1
TBRG4Q969Z0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 48.1
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