Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM63Q969Q1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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TRIM63Q969Q1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM63Q969Q1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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