Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAG5

VSTM2A, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2AQ8TAG5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VSTM2AQ8TAG5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms