Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HELBQ8NG08 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms