Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC33Q8N5R6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms