Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPAP2Q8IXW5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms