Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC9A9Q8IVB4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms