Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX7Q7RTT5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSX7Q7RTT5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms