Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2AFVQ71UI9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms