Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q71RC1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q71RC1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q71RC1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q71RC1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q71RC1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q71RC1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q71RC1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q71RC1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q71RC1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q71RC1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q71RC1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q71RC1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q71RC1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms