Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RINT1Q6NUQ1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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