Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRNP1Q6NT89 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms