Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TYW3Q6IPR3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms