Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT03

NUTM2D, NUT family member 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUTM2DQ5VT03 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NUTM2DQ5VT03 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUTM2DQ5VT03 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms