Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF3Q5SZQ8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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