Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C10orf55Q5SWW7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C10orf55Q5SWW7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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