Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PERM1Q5SV97 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms