Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COLEC12Q5KU26 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COLEC12Q5KU26 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms