Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIK1Q3SY52 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms