Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TTLL9Q3SXZ7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL9Q3SXZ7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms