Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB5Q2M3G0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB5Q2M3G0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms