Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF4Q2M2E3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF4Q2M2E3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms