Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q1T7F1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q1T7F1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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