Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIST3H3Q16695 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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