Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCAQ16586 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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SGCAQ16586 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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