Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NTRK3Q16288 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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