Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNCBQ16143 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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