Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP10Q15642 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms