Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SF1Q15637 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SF1Q15637 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SF1Q15637 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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