Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB39AQ14964 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB39AQ14964 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms