Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARF1Q14162 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARF1Q14162 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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