Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4AQ14139 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
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