Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SHROOM2Q13796 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SHROOM2Q13796 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
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