Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF5Q13568 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms