Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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BFSP2Q13515 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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BFSP2Q13515 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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BFSP2Q13515 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BFSP2Q13515 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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