Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTGDRQ13258 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTGDRQ13258 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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