Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHAF1AQ13111 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHAF1AQ13111 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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