Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MRPL28Q13084 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MRPL28Q13084 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms