Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFX1Q12986 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFX1Q12986 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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