Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPRJQ12913 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms