Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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RAB40BQ12829 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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RAB40BQ12829 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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RAB40BQ12829 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RAB40BQ12829 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RAB40BQ12829 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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RAB40BQ12829 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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RAB40BQ12829 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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RAB40BQ12829 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB40BQ12829 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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