Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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KCNMA1Q12791 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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KCNMA1Q12791 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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KCNMA1Q12791 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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KCNMA1Q12791 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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KCNMA1Q12791 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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KCNMA1Q12791 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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KCNMA1Q12791 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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KCNMA1Q12791 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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KCNMA1Q12791 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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KCNMA1Q12791 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KCNMA1Q12791 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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