Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C2orf54Q08AI8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms