Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DQ08499 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms