Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF4Q08170 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF4Q08170 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms