Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNC1Q01954 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNC1Q01954 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms