Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EXOSC10Q01780 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC10Q01780 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms